Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88aQ5SNZ0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms