Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdp2Q504M2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdp2Q504M2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms