Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnpc3Q3UZ01 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnpc3Q3UZ01 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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