Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsg1Q3UM18 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms