Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc9Q3U0M1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms