Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX1-1Q15270 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX1-1Q15270 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
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