Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLN3Q13286 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms