Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ascl1Q02067 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ascl1Q02067 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms