Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gfra1P97785 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gfra1P97785 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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