Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRB1P82279 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRB1P82279 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRB1P82279 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRB1P82279 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRB1P82279 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms