Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cct5P80316 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cct5P80316 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms