Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms