Protein–RNA interactions for Protein: P62827

Ran, GTP-binding nuclear protein Ran, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RanP62827 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RanP62827 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RanP62827 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RanP62827 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RanP62827 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RanP62827 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RanP62827 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RanP62827 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RanP62827 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms