Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms