Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccnd3P30282 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccnd3P30282 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms