Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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