Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Ccl20O89093 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ccl20O89093 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ccl20O89093 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ccl20O89093 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Ccl20O89093 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Ccl20O89093 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Ccl20O89093 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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