Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SgceO70258 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SgceO70258 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SgceO70258 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SgceO70258 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms