Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms