Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rdh16O54909 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rdh16O54909 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms