Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk4O35493 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clk4O35493 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms