Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm7945F6QI24 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms