Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm6880A3KG45 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm6880A3KG45 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm6880A3KG45 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm6880A3KG45 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm6880A3KG45 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm6880A3KG45 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm6880A3KG45 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm6880A3KG45 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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