Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itgb4A2A863 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb4A2A863 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms