Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms