Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SAMD8Q96LT4 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms