Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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USP31Q70CQ4 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP31Q70CQ4 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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