Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCDC93Q567U6 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCDC93Q567U6 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCDC93Q567U6 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCDC93Q567U6 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCDC93Q567U6 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CCDC93Q567U6 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CCDC93Q567U6 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC93Q567U6 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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