Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC061975.4-201ENST00000578466 776 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 C22orf15-202ENST00000382821 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL355526.1-201ENST00000420347 215 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 DEFA10P-201ENST00000455014 288 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LRP4-AS1-202ENST00000531719 731 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC137767.1-202ENST00000543072 752 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms