Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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