Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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