Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
BRD3Q15059 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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BRD3Q15059 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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