Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GPNMBQ14956 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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GPNMBQ14956 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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GPNMBQ14956 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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