Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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