Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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CNGB1Q14028 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CNGB1Q14028 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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CNGB1Q14028 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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