Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ITGA9Q13797 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms