Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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BFSP2Q13515 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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BFSP2Q13515 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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BFSP2Q13515 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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BFSP2Q13515 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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BFSP2Q13515 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BFSP2Q13515 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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