Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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TOP3AQ13472 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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