Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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