Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PDE3BQ13370 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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