Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms