Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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TRAF3Q13114 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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