Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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