Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
GPS1Q13098 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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GPS1Q13098 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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GPS1Q13098 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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GPS1Q13098 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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