Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TTPAP49638 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TTPAP49638 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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TTPAP49638 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TTPAP49638 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TTPAP49638 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TTPAP49638 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TTPAP49638 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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TTPAP49638 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TTPAP49638 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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