Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms