Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIRIP3Q9BW71 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIRIP3Q9BW71 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 404.8 ms