Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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RTN1Q16799 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RTN1Q16799 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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