Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA3Q16787 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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