Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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